Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Kcnb1Q03717 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kcnb1Q03717 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms