Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tff2Q03404 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tff2Q03404 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms