Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col6a2Q02788 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Col6a2Q02788 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms