Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
NfiaQ02780 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NfiaQ02780 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms