Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GscQ02591 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GscQ02591 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GscQ02591 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GscQ02591 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GscQ02591 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GscQ02591 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GscQ02591 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GscQ02591 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GscQ02591 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GscQ02591 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GscQ02591 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GscQ02591 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GscQ02591 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GscQ02591 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GscQ02591 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GscQ02591 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GscQ02591 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GscQ02591 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GscQ02591 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GscQ02591 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GscQ02591 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GscQ02591 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GscQ02591 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GscQ02591 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GscQ02591 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GscQ02591 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GscQ02591 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GscQ02591 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GscQ02591 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GscQ02591 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GscQ02591 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GscQ02591 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GscQ02591 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GscQ02591 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GscQ02591 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GscQ02591 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GscQ02591 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GscQ02591 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GscQ02591 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GscQ02591 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GscQ02591 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GscQ02591 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GscQ02591 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GscQ02591 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GscQ02591 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GscQ02591 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GscQ02591 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GscQ02591 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GscQ02591 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GscQ02591 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GscQ02591 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GscQ02591 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GscQ02591 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GscQ02591 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GscQ02591 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GscQ02591 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GscQ02591 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GscQ02591 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GscQ02591 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GscQ02591 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GscQ02591 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GscQ02591 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GscQ02591 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GscQ02591 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GscQ02591 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GscQ02591 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GscQ02591 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GscQ02591 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GscQ02591 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GscQ02591 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GscQ02591 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GscQ02591 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GscQ02591 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GscQ02591 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GscQ02591 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GscQ02591 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GscQ02591 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GscQ02591 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GscQ02591 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GscQ02591 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GscQ02591 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GscQ02591 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GscQ02591 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GscQ02591 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GscQ02591 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GscQ02591 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GscQ02591 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GscQ02591 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GscQ02591 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GscQ02591 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GscQ02591 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GscQ02591 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GscQ02591 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GscQ02591 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GscQ02591 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GscQ02591 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GscQ02591 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GscQ02591 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GscQ02591 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms