Protein–RNA interactions for Protein: Q02357

Ank1, Ankyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ank1Q02357 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ank1Q02357 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ank1Q02357 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ank1Q02357 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ank1Q02357 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ank1Q02357 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ank1Q02357 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ank1Q02357 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ank1Q02357 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ank1Q02357 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ank1Q02357 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ank1Q02357 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ank1Q02357 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ank1Q02357 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ank1Q02357 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ank1Q02357 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ank1Q02357 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ank1Q02357 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ank1Q02357 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ank1Q02357 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ank1Q02357 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ank1Q02357 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ank1Q02357 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ank1Q02357 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ank1Q02357 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ank1Q02357 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ank1Q02357 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ank1Q02357 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ank1Q02357 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ank1Q02357 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ank1Q02357 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ank1Q02357 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ank1Q02357 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ank1Q02357 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ank1Q02357 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ank1Q02357 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ank1Q02357 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ank1Q02357 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ank1Q02357 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ank1Q02357 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms