Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctnnb1Q02248 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnnb1Q02248 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnnb1Q02248 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms