Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrkcqQ02111 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PrkcqQ02111 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PrkcqQ02111 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms