Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ascl1Q02067 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ascl1Q02067 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms