Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ly9Q01965 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ly9Q01965 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms