Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VcpQ01853 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VcpQ01853 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VcpQ01853 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VcpQ01853 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
VcpQ01853 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VcpQ01853 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VcpQ01853 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VcpQ01853 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VcpQ01853 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
VcpQ01853 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
VcpQ01853 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VcpQ01853 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VcpQ01853 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VcpQ01853 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VcpQ01853 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VcpQ01853 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms