Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EgfrQ01279 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EgfrQ01279 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms