Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pde1bQ01065 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pde1bQ01065 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms