Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PrcdQ00LT2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PrcdQ00LT2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms