Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb2Q00977 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms