Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbp1Q00915 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms