Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HmmrQ00547 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HmmrQ00547 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HmmrQ00547 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HmmrQ00547 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HmmrQ00547 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HmmrQ00547 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HmmrQ00547 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HmmrQ00547 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HmmrQ00547 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HmmrQ00547 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms