Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rbbp6P97868 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rbbp6P97868 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms