Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smn1P97801 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smn1P97801 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smn1P97801 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smn1P97801 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smn1P97801 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smn1P97801 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smn1P97801 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smn1P97801 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smn1P97801 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms