Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp1b3P97370 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp1b3P97370 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp1b3P97370 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp1b3P97370 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b3P97370 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b3P97370 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b3P97370 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b3P97370 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b3P97370 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b3P97370 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b3P97370 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b3P97370 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b3P97370 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b3P97370 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b3P97370 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b3P97370 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b3P97370 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp1b3P97370 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b3P97370 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b3P97370 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b3P97370 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b3P97370 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b3P97370 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b3P97370 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b3P97370 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b3P97370 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b3P97370 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp1b3P97370 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp1b3P97370 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms