Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhodP97348 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhodP97348 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhodP97348 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhodP97348 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhodP97348 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhodP97348 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhodP97348 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhodP97348 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhodP97348 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RhodP97348 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhodP97348 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhodP97348 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhodP97348 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhodP97348 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RhodP97348 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhodP97348 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhodP97348 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhodP97348 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhodP97348 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhodP97348 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhodP97348 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhodP97348 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhodP97348 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhodP97348 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhodP97348 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RhodP97348 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhodP97348 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhodP97348 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhodP97348 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhodP97348 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhodP97348 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RhodP97348 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhodP97348 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhodP97348 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhodP97348 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhodP97348 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhodP97348 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhodP97348 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhodP97348 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhodP97348 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RhodP97348 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhodP97348 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhodP97348 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RhodP97348 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhodP97348 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhodP97348 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhodP97348 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhodP97348 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhodP97348 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhodP97348 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhodP97348 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhodP97348 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RhodP97348 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RhodP97348 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RhodP97348 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RhodP97348 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RhodP97348 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RhodP97348 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RhodP97348 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RhodP97348 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RhodP97348 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RhodP97348 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RhodP97348 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RhodP97348 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RhodP97348 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RhodP97348 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RhodP97348 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RhodP97348 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RhodP97348 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RhodP97348 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RhodP97348 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhodP97348 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RhodP97348 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhodP97348 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhodP97348 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhodP97348 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhodP97348 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhodP97348 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhodP97348 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhodP97348 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhodP97348 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhodP97348 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhodP97348 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhodP97348 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhodP97348 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RhodP97348 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RhodP97348 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhodP97348 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhodP97348 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhodP97348 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhodP97348 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RhodP97348 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhodP97348 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RhodP97348 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhodP97348 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhodP97348 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhodP97348 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhodP97348 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RhodP97348 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms