Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubg1P83887 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg1P83887 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms