Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ctps1P70698 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ctps1P70698 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms