Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp9xP70398 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp9xP70398 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms