Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad1P70340 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smad1P70340 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad1P70340 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad1P70340 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad1P70340 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad1P70340 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smad1P70340 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Smad1P70340 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smad1P70340 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smad1P70340 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Smad1P70340 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smad1P70340 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smad1P70340 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Smad1P70340 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms