Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stra8P70278 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stra8P70278 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Stra8P70278 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stra8P70278 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stra8P70278 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Stra8P70278 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stra8P70278 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stra8P70278 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stra8P70278 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms