Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NficP70255 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NficP70255 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NficP70255 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NficP70255 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NficP70255 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NficP70255 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NficP70255 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NficP70255 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NficP70255 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NficP70255 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NficP70255 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NficP70255 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NficP70255 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NficP70255 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NficP70255 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NficP70255 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NficP70255 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NficP70255 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NficP70255 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NficP70255 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NficP70255 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NficP70255 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NficP70255 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NficP70255 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NficP70255 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NficP70255 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NficP70255 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NficP70255 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NficP70255 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NficP70255 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NficP70255 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NficP70255 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NficP70255 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NficP70255 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NficP70255 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NficP70255 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NficP70255 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NficP70255 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NficP70255 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NficP70255 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NficP70255 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NficP70255 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NficP70255 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NficP70255 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NficP70255 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NficP70255 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NficP70255 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NficP70255 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NficP70255 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NficP70255 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NficP70255 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NficP70255 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NficP70255 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NficP70255 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NficP70255 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NficP70255 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NficP70255 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NficP70255 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NficP70255 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NficP70255 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NficP70255 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NficP70255 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NficP70255 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NficP70255 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NficP70255 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NficP70255 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NficP70255 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NficP70255 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NficP70255 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NficP70255 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NficP70255 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NficP70255 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NficP70255 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NficP70255 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NficP70255 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NficP70255 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NficP70255 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NficP70255 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NficP70255 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NficP70255 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NficP70255 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NficP70255 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NficP70255 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NficP70255 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NficP70255 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NficP70255 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NficP70255 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NficP70255 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NficP70255 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NficP70255 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NficP70255 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NficP70255 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NficP70255 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NficP70255 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NficP70255 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NficP70255 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NficP70255 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NficP70255 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NficP70255 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms