Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uba52P62984 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uba52P62984 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uba52P62984 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uba52P62984 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba52P62984 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba52P62984 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba52P62984 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba52P62984 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms