Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rab3cP62823 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rab3cP62823 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rab3cP62823 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rab3cP62823 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rab3cP62823 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rab3cP62823 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rab3cP62823 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rab3cP62823 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rab3cP62823 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rab3cP62823 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab3cP62823 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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