Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmo4P61969 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lmo4P61969 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms