Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vbp1P61759 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms