Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Depdc5P61460 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Depdc5P61460 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms