Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme3P61290 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme3P61290 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme3P61290 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme3P61290 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme3P61290 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Psme3P61290 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Psme3P61290 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Psme3P61290 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Psme3P61290 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Psme3P61290 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme3P61290 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme3P61290 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme3P61290 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme3P61290 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme3P61290 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme3P61290 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme3P61290 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme3P61290 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme3P61290 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme3P61290 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme3P61290 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psme3P61290 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psme3P61290 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psme3P61290 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psme3P61290 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psme3P61290 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psme3P61290 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms