Protein–RNA interactions for Protein: P61027

Rab10, Ras-related protein Rab-10, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab10P61027 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab10P61027 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab10P61027 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab10P61027 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab10P61027 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab10P61027 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab10P61027 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab10P61027 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab10P61027 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab10P61027 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab10P61027 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab10P61027 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab10P61027 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab10P61027 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab10P61027 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab10P61027 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab10P61027 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab10P61027 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab10P61027 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab10P61027 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab10P61027 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab10P61027 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms