Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ActbP60710 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ActbP60710 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ActbP60710 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ActbP60710 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ActbP60710 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ActbP60710 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ActbP60710 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ActbP60710 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ActbP60710 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ActbP60710 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ActbP60710 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ActbP60710 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ActbP60710 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ActbP60710 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ActbP60710 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ActbP60710 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ActbP60710 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ActbP60710 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ActbP60710 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ActbP60710 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ActbP60710 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ActbP60710 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ActbP60710 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ActbP60710 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ActbP60710 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ActbP60710 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ActbP60710 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ActbP60710 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ActbP60710 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ActbP60710 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ActbP60710 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ActbP60710 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ActbP60710 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ActbP60710 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ActbP60710 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ActbP60710 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ActbP60710 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ActbP60710 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ActbP60710 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ActbP60710 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ActbP60710 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ActbP60710 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ActbP60710 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ActbP60710 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ActbP60710 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ActbP60710 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ActbP60710 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ActbP60710 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ActbP60710 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ActbP60710 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ActbP60710 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ActbP60710 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ActbP60710 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ActbP60710 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ActbP60710 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ActbP60710 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ActbP60710 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ActbP60710 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ActbP60710 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ActbP60710 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ActbP60710 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ActbP60710 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ActbP60710 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ActbP60710 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ActbP60710 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ActbP60710 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ActbP60710 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ActbP60710 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ActbP60710 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ActbP60710 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ActbP60710 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ActbP60710 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ActbP60710 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ActbP60710 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ActbP60710 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ActbP60710 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ActbP60710 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ActbP60710 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ActbP60710 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ActbP60710 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ActbP60710 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ActbP60710 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ActbP60710 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ActbP60710 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ActbP60710 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ActbP60710 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ActbP60710 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ActbP60710 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ActbP60710 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ActbP60710 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ActbP60710 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ActbP60710 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ActbP60710 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ActbP60710 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ActbP60710 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ActbP60710 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ActbP60710 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ActbP60710 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ActbP60710 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms