Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcbp1P60335 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcbp1P60335 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcbp1P60335 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcbp1P60335 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcbp1P60335 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcbp1P60335 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcbp1P60335 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcbp1P60335 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pcbp1P60335 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pcbp1P60335 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pcbp1P60335 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pcbp1P60335 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pcbp1P60335 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pcbp1P60335 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pcbp1P60335 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcbp1P60335 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcbp1P60335 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcbp1P60335 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcbp1P60335 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcbp1P60335 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcbp1P60335 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcbp1P60335 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcbp1P60335 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcbp1P60335 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcbp1P60335 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pcbp1P60335 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp1P60335 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp1P60335 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp1P60335 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp1P60335 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pcbp1P60335 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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