Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sf3b6P59708 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b6P59708 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms