Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nphp4P59240 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nphp4P59240 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms