Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdrg1P59048 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdrg1P59048 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms