Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Setd4P58467 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Setd4P58467 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Setd4P58467 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Setd4P58467 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Setd4P58467 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Setd4P58467 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Setd4P58467 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Setd4P58467 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Setd4P58467 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Setd4P58467 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Setd4P58467 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Setd4P58467 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Setd4P58467 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Setd4P58467 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Setd4P58467 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Setd4P58467 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Setd4P58467 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd4P58467 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd4P58467 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd4P58467 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Setd4P58467 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Setd4P58467 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Setd4P58467 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Setd4P58467 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Setd4P58467 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms