Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dpf3P58269 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms