Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrpa1P57784 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Snrpa1P57784 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrpa1P57784 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms