Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samsn1P57725 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms