Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp25P57080 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp25P57080 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp25P57080 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp25P57080 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp25P57080 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp25P57080 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp25P57080 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp25P57080 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp25P57080 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp25P57080 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp25P57080 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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