Protein–RNA interactions for Protein: P56942

Pmch, Pro-MCH, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmchP56942 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmchP56942 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmchP56942 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmchP56942 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmchP56942 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmchP56942 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmchP56942 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmchP56942 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmchP56942 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmchP56942 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmchP56942 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmchP56942 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PmchP56942 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmchP56942 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmchP56942 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmchP56942 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmchP56942 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmchP56942 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmchP56942 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmchP56942 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmchP56942 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmchP56942 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmchP56942 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmchP56942 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmchP56942 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmchP56942 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmchP56942 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmchP56942 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmchP56942 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmchP56942 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PmchP56942 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PmchP56942 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PmchP56942 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PmchP56942 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PmchP56942 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PmchP56942 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmchP56942 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmchP56942 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmchP56942 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmchP56942 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmchP56942 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PmchP56942 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PmchP56942 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmchP56942 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmchP56942 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmchP56942 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmchP56942 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmchP56942 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmchP56942 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmchP56942 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmchP56942 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmchP56942 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmchP56942 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmchP56942 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmchP56942 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PmchP56942 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmchP56942 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmchP56942 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmchP56942 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmchP56942 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmchP56942 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmchP56942 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PmchP56942 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmchP56942 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmchP56942 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmchP56942 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmchP56942 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmchP56942 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmchP56942 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PmchP56942 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmchP56942 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmchP56942 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmchP56942 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmchP56942 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmchP56942 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmchP56942 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmchP56942 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmchP56942 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmchP56942 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PmchP56942 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmchP56942 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmchP56942 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmchP56942 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmchP56942 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmchP56942 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmchP56942 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmchP56942 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmchP56942 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmchP56942 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmchP56942 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmchP56942 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmchP56942 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmchP56942 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmchP56942 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmchP56942 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmchP56942 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmchP56942 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PmchP56942 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PmchP56942 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PmchP56942 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms