Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ctbp2P56546 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms