Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrp1P56183 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms