Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp1P55194 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms