Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtskP55097 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtskP55097 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtskP55097 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtskP55097 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtskP55097 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtskP55097 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtskP55097 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtskP55097 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtskP55097 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtskP55097 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtskP55097 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtskP55097 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtskP55097 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtskP55097 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtskP55097 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtskP55097 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CtskP55097 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CtskP55097 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CtskP55097 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CtskP55097 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtskP55097 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtskP55097 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtskP55097 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtskP55097 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtskP55097 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtskP55097 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtskP55097 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtskP55097 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtskP55097 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtskP55097 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtskP55097 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtskP55097 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtskP55097 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtskP55097 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CtskP55097 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtskP55097 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtskP55097 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtskP55097 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtskP55097 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtskP55097 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtskP55097 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtskP55097 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtskP55097 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtskP55097 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtskP55097 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtskP55097 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtskP55097 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtskP55097 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtskP55097 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtskP55097 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtskP55097 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtskP55097 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtskP55097 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtskP55097 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtskP55097 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtskP55097 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtskP55097 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtskP55097 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CtskP55097 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtskP55097 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtskP55097 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtskP55097 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtskP55097 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtskP55097 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CtskP55097 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtskP55097 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtskP55097 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtskP55097 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CtskP55097 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtskP55097 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtskP55097 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtskP55097 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CtskP55097 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtskP55097 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtskP55097 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtskP55097 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CtskP55097 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtskP55097 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtskP55097 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtskP55097 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtskP55097 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtskP55097 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtskP55097 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtskP55097 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtskP55097 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtskP55097 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtskP55097 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtskP55097 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtskP55097 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtskP55097 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CtskP55097 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CtskP55097 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtskP55097 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtskP55097 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtskP55097 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CtskP55097 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtskP55097 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtskP55097 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtskP55097 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms