Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GemP55041 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GemP55041 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GemP55041 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GemP55041 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GemP55041 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GemP55041 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GemP55041 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GemP55041 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GemP55041 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GemP55041 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GemP55041 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GemP55041 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GemP55041 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GemP55041 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GemP55041 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GemP55041 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GemP55041 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GemP55041 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GemP55041 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GemP55041 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GemP55041 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GemP55041 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GemP55041 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GemP55041 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GemP55041 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GemP55041 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GemP55041 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GemP55041 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GemP55041 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GemP55041 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GemP55041 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GemP55041 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GemP55041 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GemP55041 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GemP55041 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GemP55041 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GemP55041 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GemP55041 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GemP55041 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GemP55041 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GemP55041 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GemP55041 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GemP55041 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GemP55041 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GemP55041 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GemP55041 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GemP55041 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GemP55041 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GemP55041 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GemP55041 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GemP55041 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GemP55041 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GemP55041 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GemP55041 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GemP55041 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GemP55041 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GemP55041 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GemP55041 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GemP55041 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GemP55041 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GemP55041 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GemP55041 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GemP55041 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GemP55041 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GemP55041 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GemP55041 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GemP55041 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GemP55041 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GemP55041 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GemP55041 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GemP55041 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GemP55041 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GemP55041 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GemP55041 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GemP55041 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GemP55041 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GemP55041 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GemP55041 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GemP55041 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GemP55041 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GemP55041 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GemP55041 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GemP55041 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GemP55041 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GemP55041 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GemP55041 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GemP55041 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GemP55041 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GemP55041 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GemP55041 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GemP55041 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GemP55041 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GemP55041 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GemP55041 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GemP55041 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GemP55041 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GemP55041 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GemP55041 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GemP55041 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms